Das Kloster der Klarissen von Sant’Agata Feltria hat sehr alte Ursprünge, viel ältere als die des Gebäudes aus dem sechzehnten Jahrhundert, welches das Kloster beherbergt. Dieser Sitz, nahe der Kirche von Santa Maria Maddalena gelegen, war der alter Familiensitz der Familie Fregoso, welcher den Schwestern zu Verfügung gestellt wurde, nachdem im Jahr 1561 ein Erdrutsch das Dorf Sant’Agata Felria und damit auch das alte Kloster zerstörte. Das Kloster der Klarissen hat sich bis heute die Aktivität eines Klosters erhalten, ebenso wurden hier die ersten Regeln von Santa Chiara aufgestellt. Nach einer sorgfältigen Restaurierung ist der älteste Flügel des Klosters nun ein Gästehaus. Ebenfalls gibt es im Kloster ein Archiv, in dem zahlreiche Schriftrollen des zwölften und vierzehnten Jahrhunderts liegen, die von der Geschichte des Klosters, dem Dorf Sant’Agata Feltria und dem Gebiet Feretrano erzählen.