Das Städtische Museum und die Pinakothek von Fano sind in den Erdgeschossräumen des Malatesta Palace untergebracht. Sie können den Malatesta Fürstenhof von über den zentralen XX Settembre Platz erreichen, indem Sie durch den majestätischen Cybo Borgia Torbogen gehen. Der Cybo Borgia Torbogen, der im späten fünfzehnten Jahrhundert erbaut wurde, in denen die archäologische Abteilung des Museums, die Relikte aus der Jungsteinzeit bis hin zur römischen Kaiserzeit aufbewahrt und zeigt. Unter anderem Feuersteine, Fibeln, Bronze, Keramik, Öllampen, Inschriften, Skulpturen und Mosaike, von denen besonders die Statue des Kaisers Claudius und der weibliche Kopf mit Ottavia Haartracht aus dem späten ersten Jahrhundert vor Christus auffallen. Auf der ersten Etage, findet man die umfangreiche Sammlung antiker Münzen, die aus dem fünfzehnten und dem achtzehnten Jahrhundert datieren und die prächtige Reihe von Medaillen die von Matteo de Pasti im Jahre 1446 in Malatesta gemacht wurden, der auch der Autor der vielen wertvollen Reliefs der Malatesta-Tempel von Rimini war.
In der zweiten Etage können Sie die große Malatesta Halle und die Pinakothek besichtigen, in der die Meisterwerke aus dem vierzehnten bis zum zwanzigsten Jahrhundert untergebracht sind. Dort befinden sich auch Werke von Meistern wie Simone Cantarini, Giovanni Francesco Guerrieri, Mattia Preti, Domenichino sowie zusätzlich spektakuläre Bilder, wie die „Verkündigung“ von Guido Reni, angefertigt im Jahre 1620, und der „Schutzengel“ von Guercino. Im Zwischengeschoss befindet sich ein Raum, der sich der Herstellung der Keramik von Fano widmet, mit einer Reihe von Apotheker-Gläsen aus dem alten Krankenhaus, die mit dem charakteristischen „Pesaro pink“ dekoriert sind. Diese wurden im Jahre 1803 durch die Casari und Callegari Manufaktur hergestellt und einige andere Tischgeschirr-Stücke aus Porzellan aus dem Jahr 1782, die von dem venezianischen Hersteller Geminiano Cozzi produziert wurden.